Fíjate en las métricas DA y PA de Open Site Explorer y distribuye los enlaces hasta que ambas métricas queden más o menos equilibradas, y potencia más el PA de las subpáginas que te interese posicionar mejor en SERP's, para que te rankeen mejor.
En mi opinión, un mínimo del 30% de enlaces deberían ser deep links, para que queda natural.