Es sólo otra forma de categorizar y organizar el contenido, yo las utilizo si el contenido lo requiere, si no las evito. Pero asegúrate que no quede como contenido duplicado.
Por ejemplo tengo una web de temática de baile, y tengo las categorías que son: profesores, academias, salones de baile, eventos ...etc y luego utilizo las etiquetas para organizarlas por ciudades. Entonces si picas en la etiqueta de Madrid te saldrán los profesores, academias, evento... de Madrid