Si lo que quieres es que te aparezca una ventanita antes de lanzar el formulario de modificación debes hacerlo por javascript como bien te dice lobogris.
Yo lo haría de la siguiente manera:
HTML:
<form action="modificar.php" method="POST" name="formModificacion">
<!-- Aqui tus campos y demás cosas que modifique el usuario -->
<input type="submit" value="Modificar" onSubmit="if(confirm('¿Esta seguro de querer modificar sus datos?'){return true;}else{return false;})">
</form>
La parte
Código:
if(confirm("¿Esta seguro de querer modificar sus datos?"){return true;}else{return false;}
Saca un popup con los botones aceptar y cancelar, en caso de pulsar aceptar se lanzara el formulario que apunta a tu php, en caso de cancelar no pasara nada.
Espero que te sirva de ayuda!
P.D: El código lo he hecho aquí sobre la marcha, puede que tenga algún pequeño error sintactico.